Терапевтический эффект ТМС носит кумулятивный характер и требует курсового применения. Результат накапливается постепенно, поэтому изменения самочувствия чаще всего заметны не после первого сеанса, а по мере прохождения курса, у части пациентов — через несколько недель после его завершения. Врач отслеживает динамику на всём протяжении лечения.